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影响紫外线灭菌作用的因素是紫外线的强度、紫外线光谱的波长和照射时间。在运用紫外线灭菌器时应留意的事项为：装置方位：紫外线装置的方位离运用点越近越好，但也应留有从一端装进或抽出石英管套和替换灯管的操作空间。 流量：在同一灭菌器内，当紫外线的辐射能量一定，水中细菌含量变化不大时经过灭菌器的水流量大小对灭菌作用有显著的影响。水的物理化学性质：水的色度、浊度、总铁含量对紫外线都有不同程度的吸收， 其结果使灭菌的作用降低。 灯管功率：灯管的点着功率对灭菌功率影响很大。灯管周围的介质温度：紫外线灯管辐射光谱能量与灯管管壁的温度有关。石英管套，习惯管套的质量和壁厚与紫外线的透过率有关，石英管套的纯度高，功率好。水层厚度：水层厚度对灭菌作用有很大的联系。
微波无极紫外杀菌设备速度快、效率高、作用好。紫外线照射不会改变水的物理、化学性质，对纯水不会带如附加物所引进的污染。能适用于各种水的流量下使用，操作简单，使用方便，只需定时地清洗石英玻璃管套。 积小，简便、耗电低、寿命长。安装位置：紫外线安装的位置离使用点越近越好，但也应留有从一端装进或抽出石英管套和更换灯管的操作空间。流量：在同一灭菌器内，当紫外线的辐射能量一定，水中细菌含量变化不大时经过灭菌器的水流量大小对灭菌作用有明显的影响。 水的物理化学性质：水的色度、浊度、总铁含量对紫外线都有不同程度的吸收， 其成果使灭菌的作用降低。灯管功率：灯管的点着功率对灭菌效率影响很大。灯管周围的介质温度：紫外线灯管辐射光谱能量与灯管管壁的温度有关。
